Generative AI in Drug Design Lab

Generative AI in Drug Design Lab

Welcome to Generative AI in Drug Design Lab repository! We aim to organize recent papers related with generative AI in drug discovery, We are planning to offer tools and frameworks for generating molecules, benchmark, and visualized analysis. Join us in advancing the field of generative AI through open collaboration and innovation!

🌟 프로젝트 목표 (Project Vision)

"이론에서 실전까지, 함께 성장하는 AI 실험실"

• Drug Design에 활용되는 Generative Model 에 대한 스터디 및 프로젝트
• 개인 성장과 집단 지혜의 시너지 창출
• 오픈소스 정신을 바탕으로 한 지식 공유 문화
• 실패를 성공의 디딤돌로 만드는 실험적 접근

Introduction: 이번 시즌 스터디 목표

• 제약분야에서는 어떤 문제를 풀까? 어떤 기술이 어느 부분에 적용되고 있나?
• 각 문제를 Data, Model의 문제로 환원하는 방법
• 최신 연구의 trend. 앞으로 심도있게 연구할 분야 선정

🧑 역동적인 팀 소개 (Dynamic Team)

역할	이름	기술 스택 배지	주요 관심 분야
Project Manager	최호재		생성형 AI, 연구, 웹서비스 구축
Member	김수빈		생성형 AI, 웹/앱 서비스 구축 및 운영
Member	김예준		생성형 AI
Member	신재영		생성형 AI, 연구
Member	오성민		생성형 AI, 웹/앱 서비스 구축 및 운영

🚀 프로젝트 로드맵 (Project Roadmap)

gantt
    title 2025 AI 프로젝트 여정

    section 핵심 마일스톤
    이론 연구 및 연구 주제 탐구 :a1, 2025-03-02, 90d
    
    section 부가 활동
    기술 세미나(PseudoCon) 준비 :2025-05-10, 7d

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🛠️ 우리의 개발 문화 (Our Development Culture)

우리의 개발 문화

class CollaborationFramework:
    def __init__(self):
        self.tools = {
            'communication': 'Discord',
            'version_control': 'GitHub Projects',
            'ci/cd': 'GitHub Actions',
            'docs': 'Github Wiki'
        }
    
    def workflow(self):
        return """주간 사이클:
        1️⃣ 월요일: 논문 리뷰 발표 (Github & Notion 타임라인 공유)
        2️⃣ 화요일: 발표 후기 올리기 (본인의 blog --> Github 에 공유)
        3️⃣ 수요일: 발표 홍보 하기 (본인의 SNS 계정에 발표글 링크를 걸어서 소개하기)"""

📈 성과 지표 (Achievement Metrics)

2025 주요 KPI

지표	목표치	현재 달성률
기술 블로그 게시물	24편	0편
리뷰한 논문 수	20편	0편

💻 주차별 활동 (Activity History)

날짜	내용	발표자	발표자료
2025/03/03	OT	최호재	-
2025/03/10	프리뷰 - 제약분야에서 사용되는 다양한 모델들과 생성형 AI 소개	최호재	선정 중
2025/03/17	논문 리뷰 - RFdiffusion,	최호재, 김수빈	1,
2025/03/24	Magical Week 휴일	-	-
2025/03/31	논문 리뷰 -	이중원, 김예준	, 4
2025/04/07	논문 리뷰 -	오성민, 신재영	선정 중
2025/04/14	논문 리뷰 - Generative Flow Network 2	미정	선정 중
2025/04/21	논문 리뷰 - Generative Flow Network 3	미정	선정 중
2025/04/28	Magical Week 휴일	미정	-
2025/05/05	논문 리뷰 - Score-based Method 1	미정	선정 중
2025/05/12	논문 리뷰 - Score-based Method 2	미정	선정 중
2025/05/17	PseudoCon	-	-
2025/05/19	논문 리뷰 - Structure based method 1	미정	선정 중
2025/05/26	논문 리뷰 - Structure based method 2	미정	선정 중
2025/06/02	논문 리뷰 - Ligand based method 1	미정	선정 중
2025/06/09	논문 리뷰 - Ligand based method 2	미정	선정 중

💡 학습 자원 (Learning Resources)

우리가 만든 지식 허브

논문 리스트

• List of papers

참고자료

• 주: Valence Portal: 제약분야에서 사용되는 최신의 모델들을 파악하고 싶을 때
• 부: LAIDD: (optional) 제약분야에 대해서 self-pace 로 학습하고 싶을 때
• 부: amorehead/awesome-molecular-generation: 그나마 최근 까지 활동적인 awsome list

🌱 참여 안내 (How to Engage)

진행 정보

• 시간: 매주 월요일 오후 8시
• 장소: 온라인 (Pseudo Lab 디스코드 채널: Room-YB)

참여 조건

• 제약분야에 사용되는 AI, 기술이나, 제약회사 경력에 관심 있으신 분
• 딥러닝 기초 지식 보유하신 분
• 논문을 읽고 리뷰하실 수 있는 분

팀원으로 참여하시려면 러너 모집 기간에 신청해주세요.

• 링크 (준비중)

지원시 다음 내용을 포함해주세요

• 지원하신 동기 (5문장 이하로 작성해주세요.)
• 이번 스터디를 통해 얻고자 하는 것 - 예시) survey paper, 책,
• 제약분야 관련 경험 or AI/ML 관련 연구/스터디 경험

누구나 청강을 통해 모임을 참여하실 수 있습니다.

1. 특별한 신청 없이 정기 모임 시간에 맞추어 디스코드 #Room-YB 채널로 입장
2. Magical Week 중 행사에 참가
3. Pseudo Lab 행사에서 만나기

Acknowledgement 🙏

Generative AI in Drug Design Lab is developed as part of Pseudo-Lab's Open Research Initiative. Special thanks to our contributors and the open source community for their valuable insights and contributions.

About Pseudo Lab 👋🏼

Pseudo-Lab is a non-profit organization focused on advancing machine learning and AI technologies. Our core values of Sharing, Motivation, and Collaborative Joy drive us to create impactful open-source projects. With over 5k+ researchers, we are committed to advancing machine learning and AI technologies.

Contributors 😃

License 🗞

This project is licensed under the MIT License.